歷史沿革
本縣於民國42年2月成立「金門縣稅捐稽徵處」，掌理稅捐稽徵業務，受縣政府財糧科督導，是為本局之前身；為配合地方制度法及金門縣政府組織自治條例修正，將金門縣稅捐稽徵處更名為「金門縣稅務局」，並調整組織架構為3科1室，編制員額為18人，102年8月30日經考試院核定同意備查，並溯自102年1月20日生效。
稅務局成立伊始開徵稅目以印花稅、營業稅、使用牌照稅為主，迨52年間，中央因盱衡地區經濟發展已漸趨繁榮，縣民所得提高，應即辦理開徵新稅，藉期教育民眾對納稅之認識，旋於53年元月開徵地價稅、房屋稅、契稅、娛樂稅四項稅目，繼之於56年9月開徵土地增值稅，68年4月復開徵遺產及贈與稅，81年5月開徵證券交易稅，83年元月開徵營利事業所得稅，86年開徵綜合所得稅，86年7月1日國稅局在金門成立服務處，國稅稽徵業務移撥國稅局辦理，88年1月25日修正財政收支劃分法，營業稅劃歸國稅，本局受託代徵，迨92年元月經行政院核定營業稅移撥國稅局自行稽徵，綜計現業務職掌為土地增值稅、地價稅、房屋稅、契稅、娛樂稅、印花稅及使用牌照稅等7個地方稅目之稽徵業務。